Uma configuração incorreta do BIOS pode causar alguns problemas ... Se você se sentir confortável com isso, tente bisbilhotar no menu do BIOS suas configurações SATA. Tenha certeza que você não muda nada se você não sabe o que é o que (você pode google mais do que isso).
O disco rígido que não se encaixa no case não deve causar tanta dificuldade. Embora seja melhor deixá-lo sem correção do que tê-lo corrigido de uma maneira distorcida / contorcida.
Então, é claro que sua porta sata na mobo pode estar com defeito. Você tem apenas 2 portas disponíveis? Isso não é muito ... Qual placa-mãe você tem? Se você tiver vários, tente outras portas. Se você tiver apenas duas portas sata, poderá tentar alternar os dois cabos e verificar se há problemas para inicializar. Se for esse o caso, são seus cabos. Se depois do interruptor você ainda tiver o mesmo problema, não é.
Além disso, um novo cabo SATA custa quase nada, então não faria mal tentar. Embora na minha experiência os cabos SATA realmente funcionem ou não funcionem ... Mas quem sabe.