Se você vai misturar Windows e Linux e usá-lo ocasionalmente, provavelmente seria melhor ir com o Samba. Você não precisa instalar software adicional em nenhum dos sistemas. Apenas certifique-se de que todos os sistemas tenham compartilhamentos configurados e você possa acessá-los de todos os sistemas.
Você pode optar pelo NFS, mas no Windows é complicado configurar ( link ). Se você usasse os compartilhamentos de arquivos com frequência ou precisasse deles para produção, você poderia investigar isso.
O SSH para compartilhamento de arquivos não é muito prático. Usar o SSH é mais parecido com a transferência de arquivos, na medida em que você precisa transferir cada arquivo individual (como uma sessão FTP). Existem maneiras de contornar isso (SSHFS), mas é provavelmente mais fácil usar o Samba.