A partir da sua descrição e sem uma captura de tela, acredito que você tenha ativado um objeto com quebra de texto que força o texto a ser movido, porque esse é o comportamento que você veria nesse caso. O objeto pode ser transparente ou invisível (sem preenchimento ou traçado) e em qualquer camada.
Se é isso que está acontecendo, abra a caixa de diálogo de opções do quadro de texto ( Ctl/Cmd-B
) e marque a opção "Ignore Text Wrap" e o problema desaparecerá. Enquanto estiver lá, verifique se a justificativa vertical está definida como "Superior".
Outra possibilidade menos provável é que você tenha acidentalmente alterado o parágrafo padrão para justificar totalmente.
Uma possibilidade ainda menos provável é que você tenha acidentalmente definido um estilo de objeto padrão que atrapalhe seu texto.
Por fim, se não for nenhuma das opções acima, use a técnica de Solução de Problemas do BITS (Basic InDesign Trouble Shooter): Save As
um arquivo IDML e abra esse documento como um novo documento do InDesign. Isso remove qualquer conteúdo que possa ter sido acumulado no documento durante a edição e fornece uma nova cópia limpa para você trabalhar.