Você tem algumas opções aqui, mas nenhuma delas é muito viável.
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Unidade eSATA: Essa é, de longe, a maneira mais fácil, mas exige que os dois computadores tenham portas eSATA neles. O eSATA tem todos os benefícios de um disco rígido removível sem nenhum dos inconvenientes. Você pode instalar o Windows em uma unidade eSATA da mesma forma que faria com uma unidade interna comum e apenas Option + Inicializar os computadores para inicializar a partir dela. Infelizmente, eSATA nunca foi muito popular e declinou em uso desde que o USB3 chegou ao mercado, então encontrar computadores que os tenham é difícil.
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Windows Embedded: A Microosoft cria versões do Windows XP, 7 e 8 que são projetadas especificamente para inicializar e executar inteiramente a partir de um pen drive USB ou cartão SD. A desvantagem? Não está disponível no varejo. A única maneira de obtê-lo é comprar um dispositivo que o tenha. Ainda assim, você pode baixar uma versão de avaliação da Microsoft e ela funcionará por 180 dias - tempo suficiente para um semestre ou dois da escola :-) Você também poderá obtê-la na Microsoft Academic Alliance se sua escola participar desse programa .
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Windows To Go: O Windows 8 tem a capacidade de inicializar e executar a partir de modelos específicos de uma unidade flash USB e é totalmente suportado pela Microsoft. A desvantagem? Ele está disponível apenas nas versões Enterprise do Windows 8 e 8.1, portanto, a única maneira legal de obtê-lo é ter um contrato de licença por volume com a Microsoft. Você também pode fazer isso através da Aliança Acadêmica.
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Também existem vários hacks para fazer isso funcionar, desde que todas as máquinas nas quais você pretende usá-lo sejam conhecidas por você. É confuso e envolve muito registro-fu. Também não é suportado pela Microsoft. Já fiz isso antes, mas nunca consideraria essa opção para nada além de um experimento inteligente.
A linha de fundo aqui é que o Windows infelizmente não foi construído para fazer o que você quer, o que é uma pena considerar tanto o OS X quanto todo tipo de * nix pode fazer isso com facilidade.