Se você puder inicializar no Ubuntu, tente instalar o personalizador do GRUB. Para instalar o personalizador GRUB, digite estes comandos em uma janela de terminal ( Ctrl + Alt + T ):
sudo add-apt-repository ppa:adabbas/1stppa
sudo apt-get update
sudo apt-get install grub-customizer
Se você não conseguir inicializar o Ubuntu, faça um disco USB de inicialização ao vivo e use isso para instalar o GRUB e fazer alterações. Na primeira inicialização, o GRUB procurará todos os sistemas operacionais instalados no computador. Então você pode modificar suas preferências de inicialização. Quando você salva alguma modificação, ela aplica as correções necessárias para inicializar as janelas corretamente.
UPDATE: Já que você estragou bastante o bootloader do Windows, tente o Boot-Repair:
sudo add-apt-repository ppa:yannubuntu/boot-repair
sudo sed 's/trusty/saucy/g' -i /etc/apt/sources.list.d/yannubuntu-boot-repair-trusty.list
sudo apt-get update
sudo apt-get install -y boot-repair && (boot-repair &)
Na última aba, você encontrará um "arquivo de inicialização do Windows de reparo", verifique isso e aplique as alterações. Leia isto .
Se isso falhar, tente inicializar em um disco de reparo do Windows. Isso deve substituir o carregador de inicialização do Ubuntu: link