A maioria das pessoas argumenta que o Linux é mais seguro porque geralmente você não faz log com privilégios de root - então um vírus não pode causar muito dano (ou dano algum)
O conceito não pode ser aplicado em Windows também, uma vez que existe a opção de "Contas Padrão".
Então, as janelas não seriam tão seguras quanto o Linux?
Em relação a esse aspecto, sim. Quero dizer, se você usa janelas com uma conta limitada, não há muito dano que um vírus possa fazer sem usar ataques de escalonamento de privilégios (ignore a restrição de segurança para obter privilégios administrativos de uma conta comum).