Não conheço ferramentas que façam o que você descreve. Por isso, minha abordagem seria escrever um script para fazer isso. Eu tive sucesso no passado com eyeD3 . É uma ferramenta de linha de comando e tem uma interface de python; então você pode usar qualquer idioma que quiser. Eu estou sempre nervoso com ferramentas (ou scripts) que mudam tudo, então talvez teste com cuidado primeiro. E talvez até mesmo manter cópias originais das músicas alteradas por um tempo depois por causa da paranóia.