Por que alguns aplicativos minimizados não são encontrados na bandeja de ícones?

Question

Eu experimentei isso no XP e no Windows 7 e com aplicativos diferentes que deveriam estar na bandeja de ícones quando minimizados.

Percebi que, às vezes, o aplicativo está sendo executado em segundo plano, mas seu ícone não está na bandeja de ícones. Aqui está um exemplo com o SyncbackSE de 2BrightSparks:

Mais uma vez, eu vi isso com outros aplicativos, às vezes. Alguém sabe por que isso acontece e o que pode ser feito?

Obrigado.