Eu experameinced a situação semelhante há muito tempo, o problema era com o processo de upload de FTP, os caras de hospedagem forçaram um modificado index.html toda vez que eu tentei fazer o upload de um novo site.
também pode ser um problema do navegador você tentou pressionar ctrl + F5 depois de ver site antigo?
Como solução, faça um backup e depois exclua todos os arquivos no FTP e faça o upload site mais recente