NÃO REINICIE! Você provavelmente vai se arrepender se você fizer isso! Reparticionar uma partição NTFS leva muito tempo e, uma vez iniciada, basta deixá-la concluída.
Tendo dito isso, dependendo do que você está fazendo com essa partição, você pode acabar com problemas depois. Se você está simplesmente reduzindo o tamanho da partição, tirando parte do espaço no final, você deve estar bem; Eu fiz isso muitas vezes sem problemas.
No entanto, se você estiver redimensionando E movendo a partição do Windows, talvez você esteja com problemas. O Windows não gosta disso, e muitas vezes recompensa aqueles que tentam com a incapacidade de inicializar no Windows, às vezes de forma permanente. Eu fiz isso uma vez, e a recuperação significou inicializar o Ubuntu, acessar a partição do Windows para resgatar tudo de valor, reformatar a partição e me livrar completamente do Windows. (By the way, deu certo: eu nunca reinstalei o Windows nessa máquina e eu nunca perdi isso.)
A maneira mais segura de reduzir o tamanho de uma partição do Windows é de dentro do próprio Windows. Uma vez que você reparticionou e limpou o espaço para um novo sistema operacional, então é hora de inicializar no LiveDisk do Ubuntu (ou outro Linux) e instalar.