Parece ser um bug estranho.
Você ainda pode atualizá-lo usando o argumento -y :
yum -y update
(parará de perguntar isso)
ou uma ferramenta yes :
yes | yum update
(sempre entrará "y")
Eu iniciei um novo VPS com o CentOS 5. Como primeiro passo, queria atualizar todos os pacotes, então eu executei yum update
Mostrou a lista de pacotes a serem atualizados - 86 no total, 98 Mb de tamanho de download.
Em seguida, quando nos prompts: Is this ok [y/N]:
Eu digito y , pressiono Enter e ele fornece essa saída:
Existing on user Command
Complete!
Nada é atualizado - quando executo yum update repetidamente, a mesma coisa acontece repetidamente.
Eu fiz todos:
yum clean all
yum clean metadata
yum clean dbcache