Parece que desde o Kindle para Android versão 3.7.0.108, a Amazon começou a criptografar os arquivos mbp e, aparentemente, nenhum software pode lê-lo, infelizmente.
Uma solução alternativa que você pode tentar fazer é desinstalar todas as atualizações do aplicativo Kindle para, pelo menos, a versão 3.6.0.87, para que você obtenha suas anotações no formato .mbp, que por sua vez pode ser lido pelo aplicativo chamado "MBP Reader" (Win / Linux), feito por alguém que conseguiu fazer engenharia reversa no formato MBP. Está disponível para download aqui .
Espero que ajude.