Eu acho que é melhor não usar o Eclipse como meio para projetos de construção de curto prazo, e chamar a atenção para a linguagem original na qual eles são escritos, e scripts de automação que provavelmente são Ant. Se o seu trabalho mais fácil, e o teste é para projetos complexos, mas apenas arquivos, muito mais fácil de trabalhar diretamente com o compilador de linguagem. A única coisa útil que você pode fazer é selecionar outras configurações do wrapper Eclipse com a opção: eclipse.exe - launcher. Ini.
O eclipse Opções de tempo de execução, Argumentos da linha de comando