Estou usando o Ubuntu 12.04 com o Unity. Acabei de descobrir que não há diretório de lixo em: ~/.local/share/Trash como explicado aqui.
~/.local/share/Trash
Onde está o diretório Lixeira?
O diretório é criado depois que você excluiu seu primeiro arquivo.
Parece que você tem um problema, porque eu verifiquei e está em ~/.local/share/Trash .
Tags directory trash