Resposta curta: não use o OneNote para isso, pois ele não suporta agrupamento de objetos (ou ancoragem).
Aqui está um dos muitas páginas de pessoas implorando por isso (esta sobre o OneNote 2013).
O que você está experimentando (IMHO) é basicamente porque o objetivo do OneNote é fazer anotações, não para criar tabelas gráficas estruturadas, gráficos e folhetos.
Isso é o que o Excel, Visio e Publisher são para. :)
A (semi-) solução alternativa:
Use a ferramenta Lasso para selecionar uma seção visível (dos objetos que você deseja agrupar), copie, exclua os originais e cole o "grupo" lassoed (que agora é apenas uma figura dos objetos lassoed, não agrupados) objetos).
Maisinformaçõessobreissoeumasoluçãoadicionalagrupandocomumatabela,sãodiscutidasaqui: Objetos de agrupamento do OneNote: má solução alternativa para um recurso ausente essencial