Você realmente precisa pensar cuidadosamente sobre por que está assinando esses documentos. Se for para qualquer propósito legal, você deve obter suporte profissional para configurar uma PKI (Public Key Infrastructure) - que é o que você realmente precisa. Uma Autoridade de Certificação é apenas uma parte da PKI.
A razão para isto é que as PKI's são muito sensíveis a problemas de configuração. Quando mal configurados, são mais do que inúteis.
Se você quiser usar apenas a assinatura internamente para um número limitado de pessoas, eu simplesmente configuraria alguns certificados autoassinados usando a ferramenta de assinatura de certificado fornecida com o Office desde a configuração de uma PKI, até mesmo simples, para fazer isso não valeria a pena. Fornecer certificados autoassinados é suficiente para contornar os avisos de macro no MS Office.