Personnaly Eu só usaria um disco de recuperação como o HIREN, já que muitas vezes a recuperação do Windows não atende aos meus requisitos, como o particionamento. Você poderia instalar o Windows novamente e talvez a opção de reparo apareça?
Seus discos rígidos aparecem quando você inicializa pela primeira vez? Pode estar faltando drivers ...
Assegure-se de que o BIOS esteja configurado para inicializar a partir do disco rígido primeiro.
Eu não vi um requisito para carregar drivers por um tempo, qual interface você está usando (IDE, SATA, SCSI)? Poderia ser uma opção ruim no BIOS (SATA RAID habilitado, modo IDE desligado ...).