O RS-232 define uma lógica 1 como -15V a -3V, uma lógica 0 como + 3V a + 15V. Em uma porta serial MB típica, geralmente são em torno de -12V para 1 e de + 12V para 0. Se tiver sorte, uma das linhas de handshake de hardware na mesma porta será padronizada para o nível necessário para ativar o indicador de toque (RI), embora não tenha certeza se isso seria necessariamente verdade com o sistema no modo de suspensão.
Então, você pode tentar colocar o pino RI nos outros pinos da porta - tente um de cada vez, e você pode ter sorte. Se isso acontecer, não será necessário mais do que alguns componentes para fazer a interface entre o atmega328 e a porta.
Se isso falhar, você pode tentar usar uma bateria de 9V para tentar acordar a porta. Conecte o lado (+) da bateria ao gabinete do PC e contate brevemente a entrada RI da porta para o outro terminal da bateria. Se isso não funcionar, tente a bateria para o outro lado. Se este cenário for bem-sucedido (e o método anterior falhou), significa que seu MB não produz os níveis necessários quando a máquina está desligada, e você precisará mais do que apenas a fonte de 5V do seu atmega328. Uma bateria simples de 9V e alguns componentes devem resolver o problema.
Se nenhuma dessas duas coisas funcionar, provavelmente é algo com a configuração do MB. Se você quiser descartar isso, você pode tentar vasculhar um modem antigo e conectá-lo à porta, conectar o modem à sua linha fixa e tocar com o celular.