Eu resolvi meu problema usando EncodeHD . Ele sabe como preparar vídeo para diferentes tipos de dispositivos, e nos logs eu encontrei a linha de comando necessária para usar com o ffmpeg:
-vcodec libx264 -coder 0 -flags +loop -cmp +chroma -partitions +parti4x4+partp8x8+partb8x8 -rc_eq 'blurCplx^(1-qComp)' -me_method hex -subq 6 -me_range 16 -g 250 -keyint_min 25 -sc_threshold 40 -i_qfactor 0.71 -b_strategy 1 -qcomp 0.6 -qmin 10 -qmax 51 -qdiff 4 -directpred 1 -flags2 +fastpskip -threads 0 -level 30 -b 1012k -minrate 1012k -maxrate 1012k -bufsize 1012k -s 480x270 -r 30 -acodec aac -strict experimental -ac 2 -ar 44100 -ab 96k
Desculpe por responder minha própria pergunta. Espero que ajude alguém.