Ainda há algum poder na maioria das placas-mãe, por exemplo, para ativar o Wake-on-LAN. Além disso, os capacitores mantêm a energia mesmo depois de você desligar o computador, portanto, é preciso esperar que eles sejam totalmente drenados.
Se conseguir acesso a outro PSU, eu tentaria primeiro, mas se não, minha melhor aposta é que sua placa-mãe pode estar morrendo.