Ignore seu roteador para qualquer um desses testes, caso contrário, seu ISP os desconsiderará. Se você puder conectar seu modem diretamente ao seu NID (DMARC, NIU, etc), isso será ainda melhor, já que seu ISP provavelmente pedirá que você ignore seu IW (fiação interna) em algum momento.
Execute alguns pings contínuos, algo menos que um intervalo de 1 segundo (prefiro 200ms eu mesmo) e apenas deixe-o ir no back ground. Aponte um no DNS primário do seu provedor e outro no Google e outro em uma página aleatória com a qual você tende a ter problemas. Quando você vir um problema, compare a latência ou a perda que você vê. Isso permitirá que você saiba se é seu ISP ou apenas sua rota para um determinado servidor. Se você vir apenas problemas para a página com a qual está tendo problemas, execute um MTR ou um caminho para ele e veja onde encontrar o problema. Se esse mesmo servidor aparecer em vários testes para vários servidores, veja se o seu ISP pode colocá-lo em uma rota diferente. Se você vir problemas no DNS principal do seu ISP, isso é um problema que eles precisam corrigir. A maioria dos SLAs para perda e latência é a favor do ISP (a menos que você tenha um T1). Eles vão lhe citar algo como mais de 3% de perda em um período de uma hora ou mais de 200 ms no primeiro salto em um ping contínuo por uma hora (comum com DSL ou cabo).