Formate seu disco rígido e faça uma instalação limpa. Os sistemas operacionais não são realmente projetados para lidar com a atualização de uma placa-mãe. O Sysprep é a única maneira que eu consideraria fazer isso, mas você pode tentar iniciar o modo de segurança e desinstalar todos os dispositivos presentes no Gerenciador de dispositivos. Eu não acredito que você possa mudar entre os diferentes kernels HAL ou bootloaders, então, se você está indo do IDE para o AHCI ou do BIOS para o UEFI, você precisa limpar a instalação.