FUSE deve ser seu amigo com a ajuda de EncFS (somente criptografia) ou lessfs (criptografia e compactação)
Por um tempo agora eu tenho usado o SquashFS para meus backups mensais (geralmente em mídia ótica com informações de recuperação do dvdisaster). O formato é razoavelmente conveniente: boa compactação, pode ser montado diretamente no Linux, suporte de linha de comando em qualquer outro lugar.
No entanto, infelizmente não suporta qualquer forma de criptografia transparente. Por isso, fui forçado a manualmente GPG os arquivos antes de gravá-los. Isso também dificulta a extração: Preciso descriptografar um arquivo de vários gigabytes antes de montá-lo.
Por isso, estou procurando sugestões de formatos de arquivo que:
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