Com esse comando você só alterou as permissões para o arquivo executável, não para todos os arquivos que o programa usa (e provavelmente precisa atualizar).
Eu recomendo que você chmod o arquivo / usr / bin / zotero de volta para 755 e, em vez disso, execute o atualizador do Zotero com o sudo e ele deve ter os direitos necessários para se atualizar.
EDITAR: Recomenda-se executar sudo su
para abrir um shell de root e depois executar apenas zotero
como um comando de linha de comando para abri-lo com direitos de root. A execução direta de sudo zotero
não é recomendada porque usa seu diretório pessoal real e você pode acabar com arquivos de propriedade da raiz em seu diretório pessoal.