Você está realmente trocando usuários ou saindo e voltando? Você já tentou configurar os monitores como um usuário, efetuando logout, configurando-os como o outro usuário e reiniciando a máquina? Deve estar salvando essas configurações separadamente.
Eu mesmo testarei isso um pouco, acho que tenho uma placa de vídeo parecida por aqui.