Você deve abrir um programa com permissões de administrador para gravar em um arquivo com acesso de gravação restrito. Se você for gravar em um arquivo que requer permissões de administrador, abra o programa com permissões administrativas antes de fazer a alteração.
Se você já fez alterações e deseja salvá-las em vez de refazê-las, sugiro que salve o arquivo em outro lugar e copie o que foi alterado para o original.