A maneira mais óbvia é criar uma nova partição e instalar o Windows nela. É simples assim.
Esta questão explica como reduzir uma partição existente. Tenha em mente que a versão de 64 bits precisa de pelo menos 20GiB de espaço em disco para funcionar corretamente.
Depois de instalá-lo, ele deve se adicionar ao gerenciador de inicialização e você deve ter um menu onde você poderá selecionar qual versão deseja inicializar.
Mas para responder diretamente à sua pergunta, sim, tudo bem, contanto que você use partições separadas para cada versão do Windows.