Sim! Você consegue fazer isso. Para facilitar as coisas, eu realmente reservaria uma pequena partição para uma distribuição linux minimalista. Então instale o linux por último.
Por quê? Porque o Linux cresceu em um ambiente onde é muito menos provável que seja o único sistema operacional disponível, e como resultado ele tem muito melhores opções de carregador de boot. Você terá uma boa tela gráfica para escolher qual sistema inicializar, e deve ser capaz de detectar tudo automaticamente. Se você não gosta do linux, você nunca precisa realmente inicializar nele (exceto talvez para configurar sua tela de inicialização). Tudo o que importa é o gerenciador de inicialização.
O Windows, por outro lado, relegará você a usar o BIOS para escolher qual disco rígido inicializar ou editar o arquivo boot.ini para mostrar uma tela de texto (No XP, clique com o botão direito em "My Computer"
, escolha a guia "Advanced"
e clique no botão "Settings"
na área "Start and Recovery"
para ver a tela onde você pode configurar isso.