O problema com gabinetes externos é o calor. Unidades internas padrão esperam alguma ventilação, enquanto gabinetes externos geralmente vedam a unidade sem ventilação forçada.
Se você quiser uma unidade externa, seria melhor adquirir algo como o WD Passport, porque ele já foi projetado com a intenção de ser usado externamente. Além disso, esses tipos de drives externos, sendo direcionados para uso externo, provavelmente serão projetados para suportar mais impactos do que um drive interno padrão (recheado em um gabinete).
Agora, na medida em que sua pergunta sobre se a unidade externa ou o disco rígido do seu laptop é mais confiável, não acredito que ela possa ser respondida com precisão. A melhor coisa a fazer é supor que falhará a qualquer momento e tomar precauções para proteger seus dados! O problema com os discos rígidos e a confiabilidade é muito difícil de quantificar ou medir, e os fabricantes geralmente têm nenhum incentivo para investir em melhorias significativas para a confiabilidade. Eles podem oferecer melhor capacidade, RPM e latência, em um esforço para aumentar as vendas. No entanto, aumentar a confiabilidade por meio do projeto e do controle de qualidade custará dinheiro extra e aumentará os custos de movimentação, e não é algo quantificável que eles possam usar para comercializar e aumentar as vendas. Então, de uma unidade para outra, é muito difícil saber o que esperar.