Pode haver sérios problemas no futuro próximo.
Confusamente, SysWOW64
contém DLLs de 32 bits para uso em aplicativos de 32 bits que você executa, enquanto a pasta System32
tem binários de 64 bits.
Os arquivos DLL que estão em uso ou já existem não foram substituídos, mas provavelmente há um grupo de DLLs de 64 bits que estão em uma pasta onde apenas os binários de 32 bits devem ser carregados (muito ruim).
A reinicialização pode ter consequências. Você deve executar sfc /scannow
o mais rápido possível para minimizar qualquer perda de integridade do sistema.