Eu superei meu problema e gostaria de compartilhá-lo com outras pessoas.
De fato, Bruno me deu algumas dicas ... que talvez eu devesse estar procurando outras versões.
Eu tinha o SGE instalado via pacotes em um sistema 12.04 e um sistema 13.10. O sistema 12.04 está bem, mas o sistema 13.10 me deu os problemas descritos acima.
Minha "solução" era partir dos pacotes do Ubuntu e instalar a versão mais recente do Son of Grid Engine (8.1.6). Eu posso confirmar que o problema acima com qmon não existe mais para mim.
Ray