Se você tem ou não várias partições, é realmente uma questão de gosto pessoal
A vantagem de ter várias partições é que, se você reinstalar com frequência, pode separar seus arquivos pessoais dos arquivos do sistema (por exemplo, meus documentos no Windows XP, usuários no windows vista e / home / no linux). A desvantagem é que se você perder as partições, você precisará redimensioná-las. Pessoalmente, eu não faço várias partições - eu costumava, mas é apenas uma característica da minha caixa múltipla de inicialização porque muitas vezes era uma dor para gerenciar se você entendeu errado. o particionamento também tem um bit minúsculo de sobrecarga
A maneira mais eficaz de lidar com isso, para mim, é deixar o sistema de arquivos fazer todo o trabalho pesado e ter apenas uma partição. Dependendo do seu sistema operacional, você pode considerar a possibilidade de desduplicar os sistemas de arquivos, se possível, se realmente quiser ser eficiente.
Por outro lado, se você tiver unidades > separadas para inicialização do sistema e dados, você obtém algum grau de redundância e a capacidade de misturar e combinar unidades - por exemplo, um SSD para SO (que é mais rápido) e um grande HDD padrão para dados.