O BIOS do sistema controla em que ordem as tentativas são feitas para inicializar de cada tipo de dispositivo: disco rígido, unidade de DVD, unidade USB, LAN, etc.
Seu BIOS pode permitir que você especifique um disco rígido específico, mas provavelmente ele simplesmente dirá "Disco rígido".
Nesse caso, você terá que considerar qual das suas unidades está "marcada como inicializável". Essa configuração geralmente é feita dentro do sistema operacional. Na maioria dos casos, a unidade principal no controlador primário é inicializada primeiro, seguida pela unidade principal no controlador secundário e assim por diante.