O problema em tentar estabelecer um estudo científico dos fatores de RSI é duplo. Primeiro, o RSI geralmente leva anos antes do início, por isso não é um bom ajuste para a maioria dos testes controlados que precisam de resultados em semanas ou meses. Segundo, eles não podem fazer testes em pessoas onde o resultado esperado para alguns dos sujeitos é lesão. Como resultado, eles se baseiam em evidências anedóticas e autorrelatadas, mas depois compilar e configurar de forma que se aproxime de um estudo em grande grupo.
Com base na natureza repetitiva do R SI, qualquer coisa que possa reduzir a duração do movimento, o número de movimentos ou o esforço envolvido tem a capacidade de reduzir a chance de prejuízo. Como você citou no site do Colemak, eles podem fazer simulações a partir de cargas de digitação padrão e mostrar menos flexibilidade, menos deslocamento, etc., o que equivale a menos da repetição prejudicial. Mas provar que essa quantidade de mudança é suficiente para evitar lesões, ou que é mais eficaz do que apenas obter um teclado ergonômico curvado ou inclinado, é difícil. Infelizmente, também não há dinheiro suficiente para justificar grandes estudos, especialmente quando eles já podem exibir dados verificáveis sobre viagens com os dedos, como você citou.
Anedotamente, mudei para Dvorak na faculdade com a promessa de aumento de velocidade, o que eu achei ser verdade (passou de ~ 50 wpm em Qwerty para ~ 90 wpm em Dvorak em poucos meses de prática). Seis anos mais tarde, quando fui forçada por um trabalho a voltar para Qwerty por um ano, notei uma diferença marcante na fadiga em minhas mãos no final do dia.