Basicamente, em um RAID0, todos os outros dados são gravados em um intervalo de membro diferente (nesse caso, spans são unidades únicas). Isso significa que metade dos seus dados estão em cada unidade assim que são gravados no seu RAID.
Você não pode segmentar dados para estar em apenas uma unidade ou outra, pois o sistema operacional acessa o RAID como a 'unidade'.
Faça backup de tudo em uma terceira unidade (2 TB para armazenar tudo se o RAID estiver cheio) usando o Backup do Windows ou semelhante, substitua a unidade com falha e restaure.
Se os seus dados forem < 1TB no total, talvez considere recriar o array como um RAID1 antes de restaurá-lo.