Você pode usar o FBReader. O FBReader é um leitor de livros eletrônicos multiplataforma.
suporta vários formatos abertos de e-book: fb2, html, chm, plucker, palmdoc, ztxt, tcr (texto psion), rtf, oeb, openreader, não-DRM'ed mobipocket, texto simples, epub, eReader 1
Você pode baixar e instalar a partir do Ubuntu Software Center, ou clique na imagem abaixo:
1 Fonte: Ubuntu Apps