Você pode lançá-los em ~/.profile ou originar o arquivo relevante de ~/.profile dentro do diretório inicial do usuário raiz e, em seguida, efetuar login via sudo su - para simular um login completo. Isso funciona para mim no BASH no Snow Leopard.
Como nota lateral, defino o alias, alias ls='ls -G' , em meus arquivos .bashrc para ativar a saída de cores para ls .