Você pode desativar o alternador Alt + Tab no gerenciador de configurações do Compiz. Para fazer isso:
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Instale o gerenciador de configurações do Compiz com
sudo apt-get install compizconfig-settings-manager
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Encontre o "Gerenciador de configurações do CompizConfig" no painel, abra-o, encontre o plug-in do Ubuntu Unity, vá para a guia "Alternador" e desative todos os atalhos e caixas de seleção.
Isso desativará o pop-up do alternador de aplicativos da guia Alt +.