Qual é a diferença entre atualizar para uma nova versão de Windows 10 (como a recém-lançada versão 1607) via Windows Update comparado com a execução de Setup.exe de um DVD ou imagem ISO com o instalador para a última versão do Windows?
Estou interessado em saber o que tecnicamente acontece nos bastidores, bem como diferenças práticas, como tempo de instalação, confiabilidade e efeitos residuais.
Não há diferença alguma.
A atualização do Windows 10 1607 (assim como a atualização 1511 anterior) faz o download e descompacta os mesmos arquivos encontrados no .ISO e inicia o processo da mesma maneira.
A "atualização" não é realmente uma atualização, é uma atualização completa do SO, não importa como você a adquira.