Supondo que os atributos estejam definidos corretamente (ou seja, o arquivo não está definido como 'oculto' ou 'sistema'), provavelmente é o resultado de um programa não elevado que tenta gravar no % ProgramFiles%
Quando programas não elevados tentam gravar nessa estrutura de diretórios, eles acabam gravando em % LocalAppData% \ VirtualStore .
Por exemplo, se o aplicativo unelevated.exe tentar gravar em C: \ Arquivos de Programas \ Unelevated \ file.txt , ele realmente gravará em C: \ Usuários \ Bob \ AppData \ Local \ VirtualStore \ Arquivos de Programas \ Unelevated \ file.txt .
Outros aplicativos também podem acabar no local do VirtualStore, dependendo do como eles foram compilados .
Isso pode ou não ser corrigido em versões posteriores do MinGW .