Parece que isso não é possível, pois o Xinerama emula um único monitor virtual. Como este monitor virtual é todo software, não pode haver aceleração de hardware.
Eu resolvi isso usando uma placa gráfica com um divisor DVI integrado. O sistema operacional só pode ver um único monitor grande.
Maximizar o funcionamento do Windows depois de ajustar o compiz, veja Divida o monitor em dois .