Como é apenas um disco que você está usando, não importa se você armazena dados do programa em outra partição. Na verdade, não haveria impacto no desempenho para usar apenas uma partição. Em uma única configuração de disco, o único objetivo das parções pode ser visto na separação lógica e / ou na necessidade de outros sistemas de arquivos (digamos, o fat32 para troca de dados com outros sistemas em uma configuração de inicialização dupla).