Você instalou duas versões de vinho / vinho-mono?
Eu tive o mesmo problema, fiz os seguintes passos:
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Desinstale todos os pacotes anteriores, começando com wine usando
sudo apt-get remove 'wine*'
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Adicione o apt-repository usando
sudo add-apt-repository ppa:ubuntu-wine/ppa
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Instale o Wine 1.7 no repositório:
sudo apt-get update && sudo apt-get install wine1.7
Agora, execute o comando:
winetricks dotnet20
Para baixar o arquivo necessário e instalá-lo corretamente.