iptables é a implementação IPv4 do iptables. Para a versão IPv6, você precisa usar ip6tables
Usando o mesmo comando, mas com ip6tables deve fazer esse trabalho.
Lembre-se de fazer backup de suas regras, para iptables e ip6tables, com iptables-save > /some/path e ip6tables-save > /some/path , ou use iptables-persistent e salve as regras, para que você possa recuperar as regras se o sistema for reiniciado ou algo!