Resposta curta: SIM .
Desligar o Wi-Fi significa que o dispositivo não procurará redes para participar, por isso faz menos. Então você ganha mais vida útil de bateria para outras coisas.
Por outro lado, o iOS tem alguns aprimoramentos significativos no gerenciamento de energia que resultaram em melhor duração da bateria para mim (no meu 3GS), de modo que o aprimoramento pode ser mínimo além do que já existe.
Eu não me preocuparia com isso, a menos que você esteja longe de uma estação de carregamento.