Do comentário do artista em sua página da DeviantArt:
Obtenha acesso a um terminal e digite
rm ~/.config/autostart/compiz.desktop
Obrigado por encontrar este bug. Não tem nada a ver com o tema. Tem a ver com compiz agora tentando iniciar no Gnome-Shell, que obviamente irá quebrá-lo. Eu esta correção para o script de restauração.
Espero que isso ajude a resolver seu problema de gnomo-shell quebrado.
E, com relação ao menu Nautilus na parte superior da área de trabalho, você pode corrigir isso desativando o gerenciador de arquivos que manipula a área de trabalho.
Para fazer isso, você pode tentar gnome-tweak-tool .
Abra o gnome-tweak-tool e desative o comutador que diz "O gerenciador de arquivos gerencia a área de trabalho".