Se você abrir o Activity Monitor, o Xcode está listado?
Se não for apenas forçar, saia do Installer (item de menu Force Quit no menu Apple) e abra-o novamente.
Eu fiz o download do iPhone SDK 4 e iniciei o instalador. Tudo parecia bem até que entrou na etapa de "instalação", altura em que uma caixa de diálogo "Alerta de Instalação" foi levantada pedindo para eu fechar o Xcode. Fechei o Xcode imediatamente, mas a caixa de diálogo não fechou. Saí para sair para jantar e encontrei esta manhã que o diálogo ainda estava aberto. Eu tentei iniciar o Xcode e fechá-lo novamente, e clicar em tudo que eu encontrei. Finalmente, tentei apenas fechar o instalador usando o Command-Q, mas aparentemente os instaladores não podem sair dessa forma (uma folha de ação apareceu, explicando que o instalador estava ocupado).
Então .... e agora?
Reinicie o Mac e tente novamente.
Você pode ter o Xcode ainda em execução em uma conta de usuário diferente.
Eu tive o mesmo problema. (Eu uso Fast User Switching.) Quando eu saio do Xcode da conta usando o Activity Monitor, o instalador detecta e continua a instalação.