Crie uma partição / boot como ext4 com um tamanho de 256-512MB e outra partição que você deseja usar para lvm, usando por exemplo gparted
. Em seguida, configure manualmente para lvm (supondo que a partição que você deseja usar para lvm seja o número 5):
sudo pvcreate /dev/sda5
sudo vgcreate myvg /dev/sda5
sudo lvcreate -n swap -L 400m myvg
sudo lvcreate -n home -L 60g myvg
sudo lvcreate -n root -l 100%FREE myvg
Agora você pode executar o instalador e escolher a opção "alguma outra coisa" e selecionar os volumes lógicos que acabou de criar para o uso pretendido.