Eu não tenho uma resposta perfeita para isso, pois tenho certeza de que depende de como o aplicativo é criado.
No entanto, você pode executar o AutoHotkey para substituir ou alterar a associação com uma chave, fazendo com que ela faça outra coisa ou nada. Esta solução alternativa é aplicável à maioria dos aplicativos do Windows.
O AHK pode ser encontrado aqui e um ótimo IDE para criar scripts é SciTE4AutoHotkey .