Se você instalar o software ou Formatar até mesmo uma partição, o resto das partições permanecerá intocado. Então, se você instalar o software ou o formato C, o E será intocado.
Se a unidade não for sobrescrita, a recuperação de dados também será possível. É um pouco complicado, mas é possível.
Lembre-se sempre, se você reparticionar e formatar o disco, então os dados não poderão ser rastreados, o que permanece no disco.